Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN3Q9Y4C0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms