Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GIT1Q9Y2X7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms