Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms