Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms