Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms