Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms