Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDRG4Q9ULP0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms