Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MID2Q9UJV3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MID2Q9UJV3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms