Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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