Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD1Q9UIS9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms