Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNA9Q9UGM1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA9Q9UGM1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms