Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms