Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFDP1Q9UEE9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms