Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms