Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDE1Q9NZC3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms