Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COMMD8Q9NX08 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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