Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms