Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PNPLA3Q9NST1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms