Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNTG1Q9NSN8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms