Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSPNQ9HAW4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms