Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRDE2Q9H7Z3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms