Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms