Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms