Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
SYCP2Q9BX26 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms