Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP58Q9BVL2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms