Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
THUMPD2Q9BTF0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD2Q9BTF0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms