Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms