Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMSS1Q9BQ75 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms