Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PHF12Q96QT6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms