Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms