Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SORCS2Q96PQ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms