Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SAMD8Q96LT4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAMD8Q96LT4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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SAMD8Q96LT4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SAMD8Q96LT4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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