Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms