Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD4

AURKB, Aurora kinase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKBQ96GD4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AURKBQ96GD4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms