Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP36Q96G28 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFAP36Q96G28 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms