Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms