Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C18orf8Q96DM3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms