Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPSB1Q96BD6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms