Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFT1Q96AA3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RFT1Q96AA3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms