Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKD2Q969F2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NKD2Q969F2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms