Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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PTPRUQ92729 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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PTPRUQ92729 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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PTPRUQ92729 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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PTPRUQ92729 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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PTPRUQ92729 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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PTPRUQ92729 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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PTPRUQ92729 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
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PTPRUQ92729 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRUQ92729 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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