Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms