Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF3AQ92664 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms