Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF138Q8WVD3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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