Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC107Q8WV48 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms