Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms