Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF548Q8NEK5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms