Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNE4Q8N205 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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