Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNL1Q8IU54 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNL1Q8IU54 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms