Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms